Computers

Hoe voor te bereiden voor hele genoom sequencing

Genomics is een gebied van de technologie die in een alarmerend snel tempo verandert. Het is moeilijk te vinden van voorbeelden van andere velden die verandering op soortgelijke tarieven hebben ondergaan, maar vergelijkingen kunnen omvatten de ontwikkeling van computertechnologie over de afgelopen decennia of de snelle groei van Internet startups in de jaren negentig. In tegenstelling tot deze voorbeelden, de groei van genoom sequencing technologie is beperkt tot een bepaalde technologische sector, of op zijn minst het is geweest tot nu toe.

Wat is er veranderd?

Sequencing technologie is nu voorbij een kritisch punt is, waartegen de kosten van hele genoom sequencing is lager dan de kosten van het runnen van een conventionele panel van genetische tests. Hoewel het moeilijk voor de berekening van een exact cijfer voor dit is, ligt het waarschijnlijk in de range van $1K-$10 K. Illumina van HiSeq platform of IonTorrent van Proton beide beloven genomic rangschikken in dit bereik, evenals volledige genomica. Als we dit punt passeren, verplaatst genoom sequencing uit het rijk van onderzoek technologie naar levensvatbare klinische diagnostische test.

De gevolgen van deze veranderingen kunnen worden waargenomen in de groeiende grote belangstelling in sequencing technologie. Terwijl de technologieën op dit gebied hebben een revolutie teweeggebracht in vele gebieden van onderzoek in de afgelopen tien jaar, heeft hun gebruik in klinische instellingen ingrijpende gevolgen voor deze industrie. Onderzoek toepassingen bieden slechts een beperkte bron van winst. Verhuizen naar klinische toepassingen biedt toegang tot een veel grotere hoeveelheid kapitaal, zowel vanwege de grotere markt en hogere winstmarges.

Waar zal de nieuwe mogelijkheden?

De klinische invoering van genoom sequencing technologie verandert veel aspecten van de gezondheidszorg in de komende jaren. Genoom sequencing kon uiteindelijk de plaats innemen van een standaardonderdeel van een patiënt gezondheidszorg record, in veel de zelfde manier zoals bloedgroep en allergieën voor medicatie worden gebruikt vandaag. We hebben echter een veel weg te gaan voordat we op dit punt te krijgen. Voor ondernemers op dit gebied, komt dit neer op een scala aan spannende mogelijkheden.

1. Bio-informatica

Terwijl interpretatie van genomic een belangrijk gebied van onderzoek is, zal het toenemende gebruik van deze gegevens in klinische velden een grote vraag voor de ondubbelzinnige interpretatie van resultaten genereren. Artsen willen een ondubbelzinnige vragen zoals ziekte aanleg, en ze willen een gerenommeerde partij om de verantwoordelijkheid voor het maken van dit arrest. Onlangs, een toenemend aantal bedrijven hebt ingevoerd het gebied van genomische data interpretatie, velen van hen kleine startups zoals Genformatic, een bio-informatica bedrijf gevestigd in Austin. Grotere bedrijven hebben ook begonnen om zich te concentreren op het leveren van deze diensten. Als deze industrie evolueert, is het waarschijnlijk dat meer bedrijven dit rijk binnenkomen kunnen, en het zal interessant om te zien hoe de zaken zich ontwikkelen op dit gebied.

2. Voorbeeld Processing

Terwijl iedereen met ervaring in de moleculaire biologie de nodige vaardigheden voor te bereiden en bibliotheken worden uitgevoerd bezit, kan een heleboel dingen misgaan in dit proces. Zelfs in zuiver onderzoek toepassingen is bereiding van de monsters een steeds vaker voorkomende dienst die door een aantal centra, evenals boutique diensten, bijvoorbeeld van de organisator van het genoom ChIP-Seq dienst. Het is niet dat deze taken niet worden uitgevoerd door onderzoekers, maar wanneer ze beschikbaar voor een vergoeding zijn, ze weinig voordeel zien voor het uitvoeren van deze diensten voor zichzelf. Als genomic sequencing bewegingen in de klinische rijk, vraag naar dergelijke diensten kunnen worden verwacht om te verhogen. Er zijn niet vele ziekenhuizen met de huidige mogelijkheid om uit te voeren fundamentele monstervoorbereiding en dit is een nieuw gebied kansen op dit gebied.

3. Klinische diensten

Een van de grootste gebieden van onzekerheid in dit gebied is vandaag hoe monsters krijgt van artsen kantoren naar sequencing centra, en die patiënten van hun resultaten zal informeren. Hoewel medische leerplannen kan een dag de interpretatie van genomic gegevens omvatten, zijn we verre van dat punt vandaag. Op dit moment, zelfs de administratie en interpretatie van genetische tests is over het algemeen links naar personen op het gebied van genetische Counseling, in samenwerking met statistici en specialisten. Hoewel het is waarschijnlijk dat een scala van andere professionals de verantwoordelijkheid van dit veld in de toekomst zal overnemen, is het waarschijnlijk dat in de nabije toekomst, de groei binnen dit gebied plaatsvinden zal.